Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnd1P25322 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnd1P25322 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnd1P25322 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnd1P25322 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms