Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZfaP23607 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZfaP23607 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZfaP23607 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZfaP23607 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms