Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Edn1P22387 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Edn1P22387 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms