Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcaP20444 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PrkcaP20444 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms