Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rps6ka1P18653 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6ka1P18653 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6ka1P18653 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms