Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18533 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18533 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P18533 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P18533 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18533 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18533 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18533 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18533 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18533 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18533 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P18533 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18533 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18533 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18533 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18533 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18533 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
P18533 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P18533 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P18533 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P18533 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P18533 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P18533 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P18533 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P18533 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P18533 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P18533 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P18533 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P18533 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P18533 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
P18533 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
P18533 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms