Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spi1P17433 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spi1P17433 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spi1P17433 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms