Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd44P15379 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd44P15379 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd44P15379 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd44P15379 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd44P15379 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd44P15379 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms