Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Q9P14431 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Q9P14431 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Q9P14431 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms