Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prkar1bP12849 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Prkar1bP12849 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prkar1bP12849 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms