Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd1d1P11609 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd1d1P11609 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms