Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa1P11477 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa1P11477 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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