Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lamp1P11438 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lamp1P11438 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lamp1P11438 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms