Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RaraP11416 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaraP11416 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RaraP11416 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaraP11416 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaraP11416 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaraP11416 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaraP11416 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaraP11416 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaraP11416 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaraP11416 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaraP11416 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaraP11416 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaraP11416 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaraP11416 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaraP11416 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaraP11416 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaraP11416 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaraP11416 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaraP11416 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaraP11416 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaraP11416 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaraP11416 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaraP11416 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaraP11416 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RaraP11416 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RaraP11416 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RaraP11416 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RaraP11416 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms