Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl2P10889 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl2P10889 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms