Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp6P0C0A3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chmp6P0C0A3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp6P0C0A3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms