Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csf3P09920 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf3P09920 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms