Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa6P09092 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa6P09092 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa6P09092 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa6P09092 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa6P09092 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa6P09092 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa6P09092 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms