Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnfP06804 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnfP06804 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TnfP06804 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TnfP06804 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TnfP06804 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnfP06804 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnfP06804 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnfP06804 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnfP06804 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TnfP06804 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnfP06804 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnfP06804 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnfP06804 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnfP06804 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TnfP06804 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnfP06804 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnfP06804 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnfP06804 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnfP06804 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TnfP06804 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TnfP06804 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TnfP06804 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TnfP06804 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TnfP06804 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnfP06804 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnfP06804 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnfP06804 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnfP06804 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnfP06804 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnfP06804 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnfP06804 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnfP06804 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TnfP06804 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnfP06804 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TnfP06804 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms