Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XlrP05531 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XlrP05531 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XlrP05531 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
XlrP05531 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XlrP05531 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XlrP05531 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XlrP05531 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XlrP05531 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XlrP05531 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XlrP05531 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XlrP05531 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XlrP05531 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XlrP05531 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XlrP05531 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XlrP05531 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XlrP05531 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XlrP05531 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XlrP05531 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XlrP05531 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XlrP05531 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XlrP05531 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms