Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Got1P05201 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Got1P05201 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Got1P05201 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Got1P05201 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Got1P05201 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Got1P05201 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Got1P05201 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Got1P05201 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Got1P05201 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Got1P05201 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Got1P05201 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Got1P05201 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Got1P05201 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Got1P05201 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Got1P05201 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Got1P05201 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Got1P05201 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Got1P05201 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Got1P05201 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Got1P05201 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Got1P05201 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Got1P05201 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Got1P05201 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Got1P05201 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Got1P05201 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Got1P05201 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Got1P05201 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Got1P05201 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Got1P05201 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Got1P05201 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Got1P05201 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms