Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prp2P05143 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prp2P05143 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms