Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01792 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01792 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01792 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01792 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01792 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01792 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01792 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01792 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01792 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01792 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01792 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01792 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01792 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01792 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01792 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01792 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01792 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms