Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01741 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01741 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01741 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01741 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01741 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01741 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01741 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01741 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01741 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01741 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01741 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01741 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01741 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01741 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01741 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms