Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01660 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01660 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01660 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01660 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01660 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01660 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01660 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01660 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01660 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01660 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01660 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01660 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01660 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01660 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01660 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01660 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
P01660 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01660 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01660 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01660 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01660 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01660 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01660 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01660 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms