Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01659 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01659 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01659 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01659 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01659 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01659 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01659 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01659 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01659 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01659 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01659 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01659 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01659 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01659 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01659 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01659 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01659 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01659 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01659 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01659 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01659 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms