Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01648 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01648 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01648 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01648 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01648 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01648 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01648 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01648 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01648 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01648 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01648 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01648 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01648 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01648 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01648 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01648 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01648 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01648 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01648 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01648 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01648 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01648 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01648 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms