Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mtatp6P00848 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mtatp6P00848 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms