Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Robo1O89026 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Robo1O89026 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Robo1O89026 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Robo1O89026 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Robo1O89026 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Robo1O89026 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Robo1O89026 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Robo1O89026 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Robo1O89026 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Robo1O89026 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Robo1O89026 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms