Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apaf1O88879 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Apaf1O88879 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apaf1O88879 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apaf1O88879 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apaf1O88879 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apaf1O88879 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apaf1O88879 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apaf1O88879 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Apaf1O88879 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Apaf1O88879 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apaf1O88879 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apaf1O88879 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apaf1O88879 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms