Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F11rO88792 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
F11rO88792 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
F11rO88792 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F11rO88792 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F11rO88792 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F11rO88792 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F11rO88792 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F11rO88792 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F11rO88792 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F11rO88792 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F11rO88792 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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