Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tom1O88746 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tom1O88746 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tom1O88746 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tom1O88746 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tom1O88746 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tom1O88746 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tom1O88746 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tom1O88746 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tom1O88746 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tom1O88746 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tom1O88746 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms