Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gdap1O88741 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdap1O88741 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdap1O88741 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdap1O88741 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdap1O88741 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdap1O88741 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdap1O88741 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms