Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sap30O88574 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sap30O88574 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms