Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3bO88509 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms