Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CntfrO88507 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CntfrO88507 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CntfrO88507 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CntfrO88507 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CntfrO88507 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CntfrO88507 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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