Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dync1i1O88485 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dync1i1O88485 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dync1i1O88485 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms