Protein–RNA interactions for Protein: O88329

Myo1a, Unconventional myosin-Ia, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1aO88329 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo1aO88329 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo1aO88329 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo1aO88329 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo1aO88329 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo1aO88329 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo1aO88329 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms