Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hcn4O70507 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hcn4O70507 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hcn4O70507 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms