Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtssO70370 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtssO70370 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtssO70370 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtssO70370 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtssO70370 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtssO70370 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtssO70370 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtssO70370 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtssO70370 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtssO70370 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtssO70370 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtssO70370 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtssO70370 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtssO70370 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtssO70370 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CtssO70370 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CtssO70370 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CtssO70370 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtssO70370 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms