Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf5O70191 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf5O70191 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf5O70191 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atf5O70191 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf5O70191 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atf5O70191 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atf5O70191 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atf5O70191 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atf5O70191 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms