Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a2O55143 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2a2O55143 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2a2O55143 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms