Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nipsnap1O55125 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms