Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrxO55103 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrxO55103 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrxO55103 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PrxO55103 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrxO55103 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrxO55103 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrxO55103 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PrxO55103 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrxO55103 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrxO55103 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrxO55103 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrxO55103 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrxO55103 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PrxO55103 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrxO55103 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrxO55103 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrxO55103 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrxO55103 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrxO55103 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PrxO55103 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrxO55103 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrxO55103 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrxO55103 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrxO55103 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrxO55103 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrxO55103 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrxO55103 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrxO55103 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrxO55103 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PrxO55103 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrxO55103 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrxO55103 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrxO55103 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrxO55103 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PrxO55103 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrxO55103 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrxO55103 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrxO55103 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrxO55103 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PrxO55103 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PrxO55103 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrxO55103 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PrxO55103 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PrxO55103 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PrxO55103 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PrxO55103 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrxO55103 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms