Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngr2O55101 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr2O55101 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syngr2O55101 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms