Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trdmt1O55055 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trdmt1O55055 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trdmt1O55055 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms