Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nck2O55033 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nck2O55033 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nck2O55033 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms