Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgrmc1O55022 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pgrmc1O55022 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgrmc1O55022 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms