Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trappc3O55013 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc3O55013 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc3O55013 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms