Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bnip3O55003 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bnip3O55003 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bnip3O55003 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip3O55003 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms